потому, что диски а)тяжеловаты, давят на покрышку и приводят к её деформации, когда хранишь стоя. б) в стопке диск не даст промяться покрышке глубже, чем до смыкания дисков.
С пустыми покрышками - наоборот. Стоя они под собственным весом не проминаются - маловат. А на боку будет воздействие на боковины, заминающее их внутрь. И потом покрышка с замятыми внутрь боковинами будет хуже держаться на диске.
Еще бытует мнение, что в универсале и хэтче багажник в салоне, и поэтому они шумнее, и вонять может в салоне, если какое-то Г в багажнике везешь :)) По мне хэтчи и универсалы гораздо практичнее. Недавно сам в хэтче при сложенном заднем ряде перевез кучу громоздких предметов, которые ни в один седан просто не пометились бы.